Zehn Jahre nachdem Captain James T. Kirk das Raumschiff U.S.S. Enterprise durch die unendlichen Weiten des Weltalls steuerte bekommt er erneut das Kommando über Schiff und Besatzung. Gemeinsam mit seinen alten Führungsoffizieren Mr. Spock, Dr. Pille McCoy, Scotty, Sulu und Chekov soll Captain Kirk den Planeten Erde retten. Eine mysteriöse, zerstörerische Energiewolke bewegt sich auf die Erde zu und muss aufgehalten...